आंतरिक लेखापरीक्षा संस्थान के वित्त और प्रदर्शन संबंधी आचरण की देखरेख करने की भूमिका निभा सकती है। सामान्य वित्तीय नियम 2017 के नियम 70 में मुख्य लेखा प्राधिकरण के कर्तव्यों और जिम्मेदारियों को निर्धारित किया गया है। इसके अनुसार मुख्य लेखा प्राधिकरण को निम्नलिखित कार्य करने होंगे:

(1) वित्तीय लेखापरीक्षा

• संस्थान के वित्तीय प्रबंधन के लिए जिम्मेदार और जवाबदेह होना;
• यह सुनिश्चित करना कि संस्थान द्वारा सार्वजनिक निधियों का उपयोग उसी उद्देश्य के लिए किया जाए जिसके लिए उन्हें बनाया गया था;
• प्रदर्शन मानकों का अनुपालन करते हुए संस्थान के घोषित उद्देश्यों को प्राप्त करने में संसाधनों के प्रभावी, कुशल, किफायती और पारदर्शी उपयोग के लिए जिम्मेदार होना;
• यह सुनिश्चित करना कि संस्थान (i) वित्तीय लेनदेन का पूरा और उचित रिकॉर्ड रखता है, और (ii) ऐसी प्रणालियों और प्रक्रियाओं को अपनाता है जो कभी-कभी आंतरिक नियंत्रण को वहन कर सकें; और
• यह सुनिश्चित करना कि संस्थान (i) कार्यों के निष्पादन के साथ-साथ सेवाओं और आपूर्ति की खरीद के लिए सरकारी प्रक्रियाओं का पालन करता है, और (ii) इसे निष्पक्ष, पारदर्शी और लागत प्रभावी तरीके से लागू करता है।

(2) निष्पादन लेखापरीक्षा

• संस्थान को सौंपे गए कार्यक्रमों और परियोजनाओं के निष्पादन की नियमित समीक्षा और निगरानी करना ताकि यह निर्धारित किया जा सके कि क्या बताए गए उद्देश्य प्राप्त हुए हैं;

एक स्वतंत्र आंतरिक लेखापरीक्षा मुख्य लेखा प्राधिकरण को इन सभी कार्यों में मदद करेगी। आंतरिक लेखापरीक्षा और आंतरिक नियंत्रण दुनिया भर में सुदृढ़ वित्तीय प्रबंधन के अभिन्न अंग हैं। इसका उद्देश्य संस्थान के संचालन के वित्तीय और गैर-वित्तीय दोनों पहलुओं को देखना और संस्थान के पैसे का पूरा मूल्य सुनिश्चित करना होना चाहिए। आंतरिक लेखापरीक्षा कार्य सामान्य रूप से संस्थान के प्रशासन और विशेष रूप से वित्तीय प्रशासन में अर्थव्यवस्था, प्रभावशीलता और पारदर्शिता में सुधार करने में मदद करेगा। साथ ही, यह अधिकारियों द्वारा निर्णय लेने के लिए एक सुदृढ़ सूचना प्रणाली सुनिश्चित करने के लिए पर्याप्त जाँच और संतुलन के साथ रिकॉर्ड रखने की एक सुदृढ़ प्रणाली को बनाए रखने में मदद करेगा।

आंतरिक लेखापरीक्षा एक स्वतंत्र, वस्तुनिष्ठ आश्वासन और परामर्श गतिविधि है जिसे किसी संगठन के संचालन में मूल्य जोड़ने और उसे बेहतर बनाने के लिए डिज़ाइन किया गया है। मुख्य रूप से, इसका उद्देश्य नियंत्रण और शासन की प्रक्रिया का मूल्यांकन करने के लिए एक व्यवस्थित, अनुशासित दृष्टिकोण लाकर संगठन को अपने उद्देश्यों को पूरा करने में मदद करना है। दो-आयामी संगठनात्मक और रिपोर्टिंग संरचना के माध्यम से स्वतंत्रता स्थापित की जाती है। निष्पक्षता उचित मानसिकता से प्राप्त होती है। आंतरिक लेखापरीक्षा गतिविधि संगठन के शासन, संचालन और सूचना प्रणालियों से संबंधित वित्तीय प्रबंधन प्रणाली का मूल्यांकन करती है, जो निम्न के संबंध में है:

1. संचालन की प्रभावशीलता और दक्षता;
2. वित्तीय और परिचालन जानकारी की विश्वसनीयता और अखंडता;
3. परिसंपत्तियों की सुरक्षा; और
4. कानूनों, विनियमों और अनुबंधों का अनुपालन।

जबकि यह दस्तावेज़, अपने वर्तमान स्वरूप में, वित्तीय लेखापरीक्षा की विशेषताओं पर जोर देता है, यह आशा की जाती है कि यह दस्तावेज़ भविष्य में संशोधनों से गुजरेगा, और निष्पादन लेखापरीक्षा से संबंधित मुद्दों को भी प्रतिबिंबित करेगा।