आईआईटी जोधपुर वर्तमान में डिजिटल मानविकी में अंतःविषय डॉक्टरेट की डिग्री प्रदान करने वाले देश के अग्रणी संस्थानों में से एक है। आईआईटी जोधपुर में अंतःविषय अनुसंधान मंच इस डॉक्टरेट डिग्री कार्यक्रम की सुविधा प्रदान करता है। यह डॉक्टरेट कार्यक्रम मानविकी, सामाजिक विज्ञान, कला, प्रौद्योगिकी और इंजीनियरिंग, और प्राकृतिक विज्ञान के बीच पारंपरिक अनुशासनात्मक सीमाओं को फिर से परिभाषित करने के लिए अद्वितीय अवसर प्रदान करता है। इस कार्यक्रम को चुनने वाले डॉक्टरेट छात्रों से मानविकी, उदार कला, सामाजिक विज्ञान और कंप्यूटर प्रौद्योगिकियों के अनुशासनात्मक दृष्टिकोणों को एकीकृत करने की दिशा में योगदान करने की उम्मीद की जाती है, जिसमें अंतर-अनुशासनात्मक सिद्धांत और अनुसंधान शामिल हैं जो डिजिटल मानविकी के क्षेत्र में अग्रणी हो सकते हैं। शोध के उदाहरणों में शामिल हो सकते हैं (लेकिन इन तक सीमित नहीं हैं): डिजिटल संस्कृतियाँ / सांस्कृतिक प्रथाएँ - अतीत और वर्तमान; डिजिटल समाज; डिजिटल विरासत (संरक्षण, संरक्षण, बहाली, मनोरंजन); उपन्यासों का विषयगत कम्प्यूटेशनल वाचन; मल्टीमॉडल डेटा एनालिटिक्स; डिजिटल ज्ञानमीमांसा और विधियाँ। डिजिटल मानविकी में डॉक्टरेट अनुसंधान परियोजना-उन्मुख ज्ञान उत्पादन, विधियों के व्यावहारिक अनुप्रयोग पर आधारित होगा, और इसमें अंतःविषय सहयोग कार्यप्रवाह शामिल होगा। नियमित पीएचडी वजीफे के अलावा, प्रतिस्पर्धी आधार पर अनुसंधान के लिए अतिरिक्त वित्तीय सहायता की सुविधा दी जा सकती है।